SimBiology. 生物系統模擬工具箱
Introduction
生物系統模擬工具箱讓生物學者在一個完整的環境下模擬、建模、及分析生化路徑，藉由手動鍵入各項物種、參數、反應、規則、生物學法則、及單位等數值資料，就可以建立屬於自己的模型；或是讀取Systems Biology Mark-Up Language (SBML)底下的模型。使用者可以利用隨機或者定性來模擬模型的狀態，而且可以透過參數估計和敏感度分析來分析整個生化路徑。
本工具箱使用需搭配MATLAB。
Key Features
- 提供模塊圖表編輯器可用來建構路徑
- 提供參數估計和敏感度分析之工具
- Stochastic、stiff deterministic和nonstiff deterministic的求解功能
- 模型元件；包含：物種、各項參數、反應、規則、生物學法則、及單位等數值資料
- 儲存具有模擬設定及使用者定義型態的Project files的模型
2020b :
- 使用 SimBiology Model Builder 在單一整合視野中，互動式的建立模型；計算 Sobol 指數和執行多參數全域靈敏度分析，探索模型中的變量對模型回應的影響